生信实操ENA数据库：European Nucleotide Archive，隶属European Bioinformatics Institute, 功能类似于SRA, 对每个研究产生的数据做了详细注解，主要优势：界面简介友好，直接以表格呈现，且可直接得到原始数据文件的下载地址，并且不用花时间做fastq数据文件的转换，对有数据需求的研究人员来说这是个数据再次挖掘的金库。列举下生物数据的...阅... 阅 读 全 部 >
每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期，但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因，导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据，因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生，科研人员往往无法及时开展实验工作，因此更需要借助数据库数据，这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显，在疫情发生的早期，就陆续发表了多篇研究论文，分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
导读在农业科学中，为了提升作物农艺性状，经常会遇到将与性状相关的基因或位点在基因组上进行定位的需求，此时BSA作为一种简便又高效的分析方法便有了大显身手的机会。可是BSA究竟是怎样的一种研究方法呢，适用于什么群体呢？跟着小编了解一下吧！什么是BSA?BSA（Bulked segregation analysis）即混合分组分析，也称分离群体分组分析，是指利用目标性状存...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
其实最初并没有想要做这个健身科普系列文章，因为健身中涉及到的知识太多了，要说科普何止几篇文章可以介绍的。健身中涉及到的知识数不胜数。不过已经开始，那么今天先暂时“告一段落”，就是以快肌和慢肌作为这个系列的结束。但关于健身知识和分享不会停止。言归正传，我们来说说今天的主题。你们感觉会不会有人可以完成高强度间歇训练(HIIT)循环，却几乎跑不了几公里？或是，如果一个马拉松运动员连跳箱都...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
撰写：橘子 来源：小张聊科研平台的“ i生信”公众号，微信公众号搜索“ i生信”即可关注/扫描关注见文末大家好！今天我们来介绍一篇关于溶酶体的综述，该文章发表在Journal of Hematology& Oncology，题目为“Role of lysosomes in physiological activities, diseases, and thera...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
一、实验原理利用荧光素酶与底物结合发生化学发光反应的特性，把感兴趣的基因转录的调控元件克隆在萤火虫荧光素酶基因（firefly luciferase）的上游， 构建成荧光素酶报告质粒。然后转染细胞，适当刺激或处理后裂解细胞，测定荧光素酶活性。通过荧光素酶活性的高低判断刺激前后或不同刺激对感兴趣的调控元件的影响。同时，为了减少内在的变化因素，比如：培养细胞的数目、细胞转染和裂解的效率等对实验准确..... 阅 读 全 部 >
一．Cre-loxP重组系统作用原理1. Cre重组酶和loxP位点Cre重组酶（Cyclization Recombination Enzyme）由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码，是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性，而且与限制酶相似，能够特异性识别loxP位点。LoxP（locus of X-overP1）位点长为34bp，包括两...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
前言：后天我们的多组学文献精读会分享一篇有关 染色质可接近性的文章，考虑到大部分人可能对其中的一些概念还不了解，所以今天我们就来提前学习一下有关ChIP-seq和ATAC-seq的一些基础知识。（视频讲者：张健教授团队张月明）主要内容启动子、增强子的概念什么是基序（motif）什么是染色质可接近性什么是组蛋白修饰研...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2017年，荷兰瓦格宁根大学分子实验室RGH Immink团队以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”在《Genome Biology...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
原理提起热图，大家可能马上就能领会：热图不就是差异表达基因在不同分组样品中的表达水平吗？一般一列表示一个样品，一行表示一个基因，其中的颜色表示的相对表达值。但说到热图与机器学习，很多人都会惊讶：一个简单的热图与高大上的机器学习能扯上什么关系？都说“越熟悉越陌生”，这话放这一点儿不假；大部分人都接触或亲手绘制过热图，但在这个“过度包装”的时代（很多软件和在线工具都实现了“一...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >