ChromImpute是一款用于大规模系统表观基因组分析的软件。在大规模的系统表观组学分析中，缺失值的存在是不可避免的，为了尽可能的减小缺失值对结果的影响，这个时候我们就需要一款这样的软件，可以基于大量的数据集进行训练，从而对缺失值进行科学的插补，达到即使存在缺失值也不对最终的结果形成影响的效果。上图是经ChromImpute处理的数据，可以看到，蓝色部分是真实的观察值，红色部分是插值后的结果，经... 阅 读 全 部 >
高通量序列比对文件一般可以使用服务器查看，但是如果没有服务器，我们该如何查看呢？这时，就该Tablet软件出场了！操作步骤我们首先下载安装好Tablet软件首先，我们准备好高通量序列比对的结果文件，可以是以下格式。BAMSAMACEAFGMAQSOAPAligner这里，我们以BAM文件为例，首先，点击open这里，我们准备好BAM文件和基因组注释GTF文件打开后，可以看到CONTIG界面，我们可... 阅 读 全 部 >
新一代测序技术的发展使测序成本大为降低，测序数据也呈现爆炸式的增长。其中，转录组数据RNA-seq最受研究人员欢迎。通过分析感兴趣的器官/组织/细胞中的基因表达模式，研究人员可以更好地了解基因在不同发育时期、不同环境或是处理条件下表达水平的变化，从而进一步分析基因功能。处理大型RNA-seq数据集的工具eFP‐Seq Browser实现了用户友好的基因表达分析和可视化。说起可视化工具，大家最熟悉的... 阅 读 全 部 >
一、序列处理在线工具包（The Sequence Manipulation Suite）序列处理在线工具包是DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具的集合，是一款非常实用的序列比对分析网站。网站常用的功能包括：DNA/蛋白质序列过滤器，反序与补序工具，DNA/蛋白质序列分组工具，翻译和蛋白分子量等。 下面简单介绍一下常用功能：1DNA/蛋白质序列过滤器DNA/蛋白质序列过滤器用来从文本中移去非DNA字... 阅 读 全 部 >
▌Dstat & sariostat, vmstat, ifstat 三合一的工具，用来查看系统性能。▌Slurm查看网络流量的一个工具▌Vim & emacs真正程序员的代码编辑器。▌Screen, dtach, tmux, byobu你是不是经常需要 SSH 或者 telent 远程登录到 Linux 服务器？你是不是经常为一些长时间运行的任务而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
欢迎来到Kim教授手工课，今天来谈谈多台电脑共享一组键盘鼠标的优雅姿势，并推荐一套适用于Windows平台的免费软件解决方案，Mouse Without Borders（无界鼠标）。本文概况：〇、键鼠共享一、无界鼠标二、安装设置三、友情提示全文5000字，图片22张，请耐心学习。〇、键鼠共享作为资深办公族，桌...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
课程介绍本教程系统的介绍了AI平面设计的各个方面。课程内容结合实际，由浅入深，循序渐进，初学者能很快上手，能使想从事平面设计的人员得到启发，也是相关爱好者学习的不二之选！。本教程理论结合实际、采用循序渐进的讲解方法，让大家学习后对平面设计有一个全面清晰的了解。学习地址百度：https://pan.baidu.com/s/1RkARdYxXMe11sn8Y8Aa9...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Office 2013-2019 C2R Install v7.3.5是由俄罗斯人Ratiborus制作的Microsoft Office下载、安装、管理的自定义部署工具。它可以在线下载安装 Office 2013-2019 的各个版本，离线安装部署Office镜像，自定义安装Office产品组件，支持Office零售版转换批量许可版，在线KMS激活Office，可选内置Office...阅读全文... 阅 读 全 部 >
1.环境：CentOS7+已安装好miniconda 2.conda安装wget<pre>conda install wget</pre>3.下载conda环境文件<pre>wget https://data.qiime2.org/distro/core...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染色质沉淀数据和表观遗传学修饰等。使用者可以选择多种显示模式，以heat map、柱状图、散点图...阅读全文... 阅 读 全 部 >