据 JPR 称，GPU 市场预计到 2025 年将达到 33.18 亿台，年增长率为 3.5%。该统计数据清楚地表明，近年来 GPU 在机器学习中的使用有所发展。深度学习（机器学习的一个子集）需要处理海量数据、神经网络、并行计算和大量矩阵的计算。所有这些方法都使用处理大量数据并将其转换为可用软件的算法。这需要使用图形卡进行处理，以通过深度学习和神经网络执行这些任务。GPU 在这里发挥...阅读全文... 阅 读 全 部 >
编者按受体配体的相互作用是复杂器官实现细胞间信息交流的途径，肝脏作为哺乳动物体内重要的器官之一，其细胞通讯网络图谱一直未被阐明，本研究将健康和非酒精性脂肪性肝炎小鼠肝脏中的非实质细胞进行单细胞测序，为健康和疾病中的肝脏细胞间通讯和重编程提供了新的见解。基本信息样本：健康和非酒精性脂肪性肝炎小鼠肝脏（n=6）方法：10x Genomics单细胞转录组测序年份：2019期刊...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
分享8个非常实用但是名气不大的软件1、uToolsuTools是一个非常强大的生产力工具箱软件，它自由集成了丰富的插件，可以快速匹配场景功能，用完即走。uTools优秀的插件化设计，让你可以自取所需，任意组合。插件一般仅数百KB大小，简洁美观、没有广告，解决你问题的，一个插件即可。uTools作者将此软件设计为”一切皆插件“的插件化工具，所有的功能均可通过插件实...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
以下13款免费实用软件，全都是自用推荐，使用时长0.5-3年不等！第4款和第5款，简直不要太全能，一个抵千个！一、系统工具1、清理工具Glary Utilities一款简洁但强大的系统清理与优化工具，能够修复、增强、清理以及保护你的电脑。支持的功能有：一键清理电脑垃圾、注册表修复和清理、修复无效的快捷方式、重复/空文件查找、卸载电脑软件、进程管理、系统...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
背景知识：哺乳动物的三维（3D）组织基因组在基因调控中起到重要作用，如增强子对靶基因具有很强的调控作用，拓扑关联域(TADs)是哺乳动物基因组组织的基本单位。Hi-C, ChIA-PET, Capture-C, Capture Hi-C, PLAC-Seq and HiChIP等染色体构象捕获技术的出现，使基因组空间组织的研究越来越得到重视。因此大量的染色体互作数据不断增加，如何高效快速的...阅... 阅 读 全 部 >
前言随着测序技术的发展，一些大规模的癌症基因组项目，例如癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas ,TCGA）和国际癌症基因组联盟（International Cancer Genome Consortium ,ICGC）收集了大量多维度的癌症基因组数据，同时这也给癌症基因组数据的整合、研究和分析带来了更大的挑战。因此，今天给大家介绍一款比较经典且好用的综合性数...阅读全文... 阅 读 全 部 >
TCGA生信挖掘必备数据库合集小伙伴们大家好，肿瘤相关的生信文章绝大多数离不开TCGA数据库（ https://portal.gdc.cancer.gov/）。但新手小白们可能对这个网站中的数据无从下手，或者仅仅知道寥寥几个相关网站还没能探索到相关的神奇功能。那么，我就来为大家总结一下TCGA生信挖掘必备的数据库合集吧！ 最权威的网站资源1.cBioPortal（http://www.cbiopo... 阅 读 全 部 >
数据集为“2012年TCGA发表的乳腺癌的研究”；分析类型，确定数据分析类型，以突变数据、拷贝数数据和表达数据为例；检索的基因，以“ERBB2”为例。点击Submit后会得到如下结果。OncoPrint页面显示的是检索的基因在所有样本中的突变、拷贝数、表达情况，如ERBB2在463个乳腺癌样本中发生变化的样本数目是89个，其中图中一个小竖条代表一个样本。把鼠标放到某个样本上可以显示更多信息，点击其... 阅 读 全 部 >
今天就跟大家聊聊有关HACER human增强子数据库的示例分析，可能很多人都不太了解，为了让大家更加了解，小编给大家总结了以下内容，希望大家根据这篇文章可以有所收获。大多数的增强子数据库利用chip_seq,DNase_seq和CAGE_seq的数据来鉴定增强子, HACER则通过GRO_seq和PRO_seq来分析增强子RNA，从而达到鉴定已经激活的增强子的目的。与其...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
这期内容当中小编将会给大家带来有关人和小鼠中的超级增强子数据库dbSUPER该怎么理解，文章内容丰富且以专业的角度为大家分析和叙述，阅读完这篇文章希望大家可以有所收获。dbSUPER是超级增强子数据库的开山之作，文章发表在Nucleic Acids Research上，链接如下https://academic.oup.com/nar/article/44/D1/D164...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >