2023
12-15
12-15
靶标确证
这阶段是确证选定靶标的调控会引发预期的生物效应并与临床治疗相关。常用的方法有基因突变、基因敲除、使用抗体、药物抗性突变和siRNA等。值得关注的是，51%的临床二期的失败都是由于药效不够，很多都归因于前期靶标确证工作的不足。这一阶段的失败随之而来的是后期巨额投入的付之东流。疾病关联临床靶标确证平台（https://www.targetvalidation.org/）整合了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
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这阶段是确证选定靶标的调控会引发预期的生物效应并与临床治疗相关。常用的方法有基因突变、基因敲除、使用抗体、药物抗性突变和siRNA等。值得关注的是，51%的临床二期的失败都是由于药效不够，很多都归因于前期靶标确证工作的不足。这一阶段的失败随之而来的是后期巨额投入的付之东流。疾病关联临床靶标确证平台（https://www.targetvalidation.org/）整合了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2023
11-04
11-04
用Excel就能分析生物数据，真后悔没早点安装插件GenAlEx
GenAlex是一款应用于EXCEL的生物数据分析工具插件，运行后可以在Windows的excel中使用，功能强大又好上手。它可以对共显性数据、单倍体数据和二元数据进行分析。GENALEX还提供了一系列基于频率的分析， 20多种不同的图表总结数据辅助检测。除此之外，序列信息和基因型数据可以方便地在相关软件中转化格式。操作步骤建立一个表格，第一行首先写上位点数，个体数，居群数，然后开始与第二行对应标... 阅 读 全 部 >
2023
10-07
10-07
GENEPOP：一个非常实用的群体遗传学分析软件
GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。下面我们就来介绍一下它的使用方法。操作步骤先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下，删除其他之前运行剩下的结果文件，仅保留三个文件运行软件，输入输入文件的名称确认信息，回车可以进行很多项分析一共有8个选项：1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种... 阅 读 全 部 >
2023
06-10
06-10
如何0成本做出花了30w经费的感觉？这篇最新6+SCI教你逆袭！
Notch信号通路在癌症中的作用分析基因在癌症中作用的文章，一般都是分析单基因或者基因家族，今天让我们一起通过2021年6月发表在Cancers (IF:6.639)上的文章“A Comprehensive Bioinformatics Analysis of Notch Pathways in Bladder Cancer”，来看看如何分析信号通路在癌症中的作用吧~期刊简介要素拆解题目：膀胱癌 ... 阅 读 全 部 >
2023
05-15
05-15
手把手教你从转录组数据中筛选关键基因
转录组分析最重要的目的之一就是筛选候选基因，那怎么从海量数据中筛选目的基因成为大家的困惑。这里小编经过归纳总结得出了下面的三种方法： 筛选关键基因的方法有3类：1.表达量﹢功能富集2.表达量﹢实验3.表达量﹢序列根据上面的三种方法不难看出，筛选关键基因的核心是表达量，其实转录组的核心就是以表达量为核心展开其他分析的，然后再附加其他一些信息，找出目标基因；最后将分析结果与研究目的巧妙融合，如果再做一... 阅 读 全 部 >
2023
05-14
05-14
选好基因，单基因泛癌发7分+也不难！
作者：作图丫导语GUIDE ╲CDCA4（细胞分裂周期相关蛋白4）参与细胞周期调节，是癌症的潜在的生物标志物。背景介绍2022年啦，单基因泛癌生信还可以发高分吗？当然是可以的！今天小编给大家带来一篇刚刚发 表在Front Immunol（IF=7.6）的单基因泛癌文章，本文的所有生信分析部分基本都是使用数据库或者web工具完成的，很有借鉴意义。 题目为 ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023
05-14
05-14
带你一网搞定基因间错综复杂关系
在分子机制的研究中，寻找基因间互作网络是非常重要的。基因间的关系，又可分为蛋白与蛋白之间，蛋白与 DNA之间的相互作用、通路、生理生化反应、共表达、共定位等等。下面介绍一下GENEMANIA数据库，你想知道的数据全都有，网址 http://genemania.org/1打开网址页面如下，首先在网站左上角，有一个搜索栏2输入你想查询的基因名称，点击前面的图标可以选择物种3点击搜索后，可以看到如下界面... 阅 读 全 部 >
2023
05-13
05-13
红花光调控信号途径关键基因CtHY5的克隆及表达分析
转录因子HY5（ELONGATED HYPOCOTYL5）是基本亮氨酸拉链类（basic leucine zipper，bZIP）转录因子类的转录因子，最早是在拟南芥中克隆得到[1]。HY5编码的蛋白为光敏色素下游的核心光信号调节因子，在光信号通路中具有十分重要的作用，HY5的C末端具有特殊的bZIP结构域，能够直接与基因启动子作用元件G-box（CACGTG）相结合，从而能调控基因的表达它能通过... 阅 读 全 部 >
2023
05-12
05-12
献给初学者：如何预测基因间的相互作用？
对于生物学领域的研究生来说，很多时候我们研究一个通路，或者想要知道两个基因或者多基因间的相互作用以及蛋白质之间的相互作用，该从哪下手呢？下面我想详细的介绍一个基因间相互作用的预测网站—GeneMANIA，网址： http://genemania.org。首先看 Help 里对 GeneMANIA 的简介：GeneMANIA searches many large, public...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2023
05-12
05-12
探索基因间相互作用和功能，除了string还有更友好的它！
简洁、明了、好用之前我们介绍了快速寻找RNA与RNA、蛋白质、DNA和化合物相互作用的好用网站，今天我们一起来看一下另外一个好用的数据库。该数据库用于生成有关基因功能的假设、分析基因列表和为功能分析确定基因的优先级。给定一个查询基因列表，GeneMANIA使用大量的基因组学和蛋白质组学数据发现功能相似的基因。在这种模式下，它根据查询的预测值对每个功能基因组数据集进行加权。GeneMANIA的另一个... 阅 读 全 部 >