Notch信号通路在癌症中的作用分析基因在癌症中作用的文章，一般都是分析单基因或者基因家族，今天让我们一起通过2021年6月发表在Cancers (IF:6.639)上的文章“A Comprehensive Bioinformatics Analysis of Notch Pathways in Bladder Cancer”，来看看如何分析信号通路在癌症中的作用吧~期刊简介要素拆解题目：膀胱癌 ... 阅 读 全 部 >
转录组分析最重要的目的之一就是筛选候选基因，那怎么从海量数据中筛选目的基因成为大家的困惑。这里小编经过归纳总结得出了下面的三种方法： 筛选关键基因的方法有3类：1.表达量﹢功能富集2.表达量﹢实验3.表达量﹢序列根据上面的三种方法不难看出，筛选关键基因的核心是表达量，其实转录组的核心就是以表达量为核心展开其他分析的，然后再附加其他一些信息，找出目标基因；最后将分析结果与研究目的巧妙融合，如果再做一... 阅 读 全 部 >
作者：作图丫导语GUIDE ╲CDCA4（细胞分裂周期相关蛋白4）参与细胞周期调节，是癌症的潜在的生物标志物。背景介绍2022年啦，单基因泛癌生信还可以发高分吗？当然是可以的！今天小编给大家带来一篇刚刚发 表在Front Immunol（IF=7.6）的单基因泛癌文章，本文的所有生信分析部分基本都是使用数据库或者web工具完成的，很有借鉴意义。 题目为 ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
在分子机制的研究中，寻找基因间互作网络是非常重要的。基因间的关系，又可分为蛋白与蛋白之间，蛋白与 DNA之间的相互作用、通路、生理生化反应、共表达、共定位等等。下面介绍一下GENEMANIA数据库，你想知道的数据全都有，网址 http://genemania.org/1打开网址页面如下，首先在网站左上角，有一个搜索栏2输入你想查询的基因名称，点击前面的图标可以选择物种3点击搜索后，可以看到如下界面... 阅 读 全 部 >
转录因子HY5（ELONGATED HYPOCOTYL5）是基本亮氨酸拉链类（basic leucine zipper，bZIP）转录因子类的转录因子，最早是在拟南芥中克隆得到[1]。HY5编码的蛋白为光敏色素下游的核心光信号调节因子，在光信号通路中具有十分重要的作用，HY5的C末端具有特殊的bZIP结构域，能够直接与基因启动子作用元件G-box（CACGTG）相结合，从而能调控基因的表达它能通过... 阅 读 全 部 >
对于生物学领域的研究生来说，很多时候我们研究一个通路，或者想要知道两个基因或者多基因间的相互作用以及蛋白质之间的相互作用，该从哪下手呢？下面我想详细的介绍一个基因间相互作用的预测网站—GeneMANIA，网址： http://genemania.org。首先看 Help 里对 GeneMANIA 的简介：GeneMANIA searches many large, public...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
简洁、明了、好用之前我们介绍了快速寻找RNA与RNA、蛋白质、DNA和化合物相互作用的好用网站，今天我们一起来看一下另外一个好用的数据库。该数据库用于生成有关基因功能的假设、分析基因列表和为功能分析确定基因的优先级。给定一个查询基因列表，GeneMANIA使用大量的基因组学和蛋白质组学数据发现功能相似的基因。在这种模式下，它根据查询的预测值对每个功能基因组数据集进行加权。GeneMANIA的另一个... 阅 读 全 部 >
大黄为蓼科植物掌叶大黄Rheum palmatumL.，唐古特大黄R. tanguticumMaxim. ex Balf.或药用大黄R. officinaleBaill.的干燥根及根茎，具有利湿退黄、凉血解毒、逐淤痛经、清热泻火等功效。现代研究表明，大黄酸、大黄素、大黄酚、大黄素甲醚和芦荟大黄素5种蒽醌类物质是大黄主要的药效成分，具有泻下、抗菌、抗炎、抗肿瘤、利尿、抗凝血、抗衰老、免疫调节等多种药... 阅 读 全 部 >
种数据挖掘文章本质上都是要把目标基因集缩小，比如表达量矩阵通常是2万多个蛋白编码基因，不管是表达芯片还是RNA-seq测序的，采用何种程度的差异分析，最后都还有成百上千个目标基因。如果是临床队列，通常是会跟生存分析进行交集，或者多个数据集差异结果的交集，比如：多个数据集整合神器-RobustRankAggreg包 ，这样的基因集就是100个以内的数量了，但是仍然有缩小的空间，比如lasso等统计学... 阅 读 全 部 >
想验证miRNA和靶基因的靶向互作？想知道转录因子与启动子的调控机制？想研究启动子的结构？想分析转录因子的转录激活……这些统统可以用双荧光素酶报告基因检测实验来实现，是不是很强大！那么如此强大的实验你了解多少呢？这么多的应用你会不会一脸懵呢？双荧光素酶报告基因到底是个啥“玩意儿”可以进行做这么多的实验？这些问题想要找到答案就跟着小远的文章往下看吧！原理简介荧光素酶（Luc...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >