一、序列处理在线工具包（The Sequence Manipulation Suite）序列处理在线工具包是DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具的集合，是一款非常实用的序列比对分析网站。网站常用的功能包括：DNA/蛋白质序列过滤器，反序与补序工具，DNA/蛋白质序列分组工具，翻译和蛋白分子量等。 下面简单介绍一下常用功能：1DNA/蛋白质序列过滤器DNA/蛋白质序列过滤器用来从文本中移去非DNA字... 阅 读 全 部 >
什么是泛基因组？泛基因组（pan-genome）作为一个概念出现的时间并不长，相应的研究文献也并不多。但它作为基因组学研究积累到一定阶段而出现，在更大尺度上进行的研究，甫一面世便受到了研究者广泛的关注。泛基因组(pan-genome)指一个群体中所有基因组的总和，其中前缀pan来源于希腊语“παν”（指全部）。泛基因组通过对一个物种中多个个体或是一个分类群体中多个物种的基因组信息进行分析...阅读... 阅 读 全 部 >
每个编码的人都有自己喜欢的语言。拥有一种首选语言有很多原因，但是，我们的语言有时会变得很单调，它不再由制造它的公司维护，或者人们出于某种无法解释的原因放弃使用它。但是，也有的编程语言例外，比如C语言，它就经受住了时间的考验，在许多情况下仍然是最流行的编程语言。编程语言都有自己的生命周期，对某些语言来说，属于它们的时代似乎已经结束了，今天，我们就来盘下一下目前前景最黯淡的5种语言：...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
近年来，越来越多的研究表明，单一或者少数参考基因组不能涵盖整个种群全部的遗传信息，所以，构建物种的泛基因组成了当前基因组学研究的热点和前沿。本篇文章，小编和大家一起来了解一下泛基因组的构建方式、泛基因组的热点研究内容。一、泛基因组的构建策略泛基因组构建主要分为以下三种方式[1]：（1）选取一个参考基因组，各个材料的测序reads分别比对，将未比对上的reads进行组装，通过“比对-组装”的迭代过程... 阅 读 全 部 >
xftp中使用的是ASCII字符，所以一旦文件名中包含了非ASCII字符，就会出现文件名乱码的情况，本集就同大家分析一下出现此等错误时要怎么处理。问题现象：如果文件名中包含非ASCII字符则文件名就会出现乱码样式，例如：在Xshell中显现如下图1所示：图1：在xshell中文件名乱码在Xftp中的现象如下图2所示：图2：xftp文件名出现乱码现象在Xshell中有选项可以设置...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
很多同学会有疑问，为什么我看到很多大牛的视频里面敲代码的时候，输入一个template，就会出现一大块代码。为什么我输入一个template，只有这一个单词，啥也没出来别墨迹，快解决闲话不多说，我们就来聊一聊如何--懒省事（在VsCode里面设置自定义的模板）首先：我们要找到这个模板设置的入口在文件 - > 首选项 - > 用户代...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
Visual Studio Code 是一款轻量级但功能强大的源代码编辑器，适用于 Windows、macOS 和 Linux。内置了对 Java、Type 和 Node.js 的支持，并为其他语言（例如 C++、C#、Java、Python、PHP、Go）并且提供了丰富的扩展生态系统。今天我将给大家介绍 VsCode 常用操作及非常棒的插件， 喜欢本文记得收藏、点赞、关注...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
gff3格式注释文件是最常见的基因注释，（https://archive.broadinstitute.org/annotation/argo/help/gff3.html）简单来说，gff3是以tab分隔的文本文件，共有9列，对应信息如下：1、seqname The name of the sequence. Typically a chromosome or a contig. Argo ..... 阅 读 全 部 >
先普及下一些常识：天河二号超级计算机 “天河二号”是由国防科学技术大学研制的超级计算机系统，以峰值计算速度每秒5.49亿亿次、持续计算速度每秒3.39亿亿次双精度浮点运算的优异性能位居榜首，成为全球最快超级计算机。2014年11月17日公布的全球超级计算机500强榜单中，中国“天河二号”以比第二名美国“泰坦”快近一倍的速度连续第四次获得冠军。2015年5月，“天河二...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
▌Dstat & sariostat, vmstat, ifstat 三合一的工具，用来查看系统性能。▌Slurm查看网络流量的一个工具▌Vim & emacs真正程序员的代码编辑器。▌Screen, dtach, tmux, byobu你是不是经常需要 SSH 或者 telent 远程登录到 Linux 服务器？你是不是经常为一些长时间运行的任务而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >