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2024
02-03

单细胞数据库强势来袭

导语GUIDE ╲近几年，单细胞的研究蔚然成风，受到很多科研人员的青睐。小编为大家整理了迄今为止，最全的单细胞线上数据库，可以帮助你更准确地进行细胞注释和分析，也可以用作研究前期的数据探索。单细胞数据库分类Human Cell Landscape (HCL)Human Cell Atlas (HCA )Human Protein Atlas (HPA)SC2di...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2024
02-03

零代码搞定单细胞数据分析！看这篇就够了！

单细胞测序技术能够精确细分每个细胞独特的基因表达特征，深入研究细胞间的相互作用关系，在肿瘤免疫等方面成为人们越来越看重的技术，热度也是不断上涨。随着热度的增加，关于单细胞的文献数据也是爆炸性增长！大家在学习单细胞技术和写论文时，很多问题也是爆炸性增长！那么如何快速找到需要的单细胞数据？有哪些好用工具可以帮助我们完成日思夜想的论文？今天小编在这里挑选了一些好用且有特色的单细胞数据库分享给大家。1、P... 阅 读 全 部 >

2023
12-03

科普 | DisGeNET，与疾病相关的基因公开数据库有什么好的？

DisGeNET数据库是一个与疾病相关的基因数据库，整合了来自各种存储库（包括孟德尔，复杂和环境疾病）的人类基因疾病协会（GDA）和变异疾病协会（VDA）的信息。具体技术包括对基因-疾病词汇的mapping、DisGeNET本体分析。网址：https://www.disgenet.org/目前的版本DisGeNET v4.0，包含17,381个基因，15,093 种疾病、异常和...阅读全文>... 阅 读 全 部 >

2023
09-30

SSRN被收购，学者们不干了，他们重起炉灶搞了一个新的社会科学开放平台

社会科学研究网（Social Science Research Network，简称SSRN)，是一个致力于快速地在世界范围内传播社会科学研究成果的网站。它是由大量的各个社会科学分支专门研究网络组成，并组成了一些专门的研究网络。作为一个免费的社会科学论文存储开放平台，内容包括财经、会计、法律、经济、管理等类别，目前已收藏20多万篇可供免费下载的工作论文全文，另外还提供30多万篇论文的摘要...阅读... 阅 读 全 部 >

2023
09-30

建议收藏，这25个英文网站助力于你的论文

英文文献一直是个令人头疼的问题光是找下载网站就需要花大把的时间！不用担心~为大家整理了25个免费英文文献下载网站，赶紧收藏+转发！TIPS：大家可以用google浏览器打开网址，一键翻译成中文，如果是英语大神可忽略本TIPS。1.香港科技大学图书馆 Dspacehttp://repository.ust.hk/dspace包括香港科技大学的学...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2023
08-20

开放数据库Dryad在临床研究领域中的应用

第一节：开放数据库Dryad在临床研究领域中的应用第二节：Dryad在心血管疾病研究领域案例分析作者：王晓燕1 白英楠2 戴启盈3 赵公双41.复旦大学中山医院，心内科2. 复旦大学中山医院，心内科3. Metrowest Medical Center, Framingham, MA, USA4. 沈阳军区总院，心内科第一节 开放数据库Dryad的使用1. Dryad数据库...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >

2023
06-17

【生物信息学笔记】欧洲生物信息中心（EBI）资源

我们接着讲生物信息学的资源，之前我们介绍了NCBI，欧洲也有一个非常大的centralized resource，叫EBI 。和NCBI有点类似，也是一个包含各种各样数据库这样的资源，它主要也是针对从序列到蛋白到蛋白结构到表达到通路到Ontology各个方面。首先在DNA，RNA和蛋白的方面，基因和基因组最主要是有一个ensembl，很多人不知道EBI也会知道ensemb...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >

2023
05-01

懒人福音，做ceRNA的都给我进来看！

LncACTdb 2.0数据库食用指南Hello，小伙伴们大家周三好~本周我们继续来讨论一下lncRNA的一个大热功能，也就是lncRNA的ceRNA机制。ceRNA是个啥，相信各位小伙伴们已经非常清楚了，无论是酸谈老师的直播还是文献品谈会都介绍了大量的ceRNA的案例文献。在ceRNA的机制中，一共有三个变量参与，以lncRNA为例，最最常见的ceRNA结构就是lncRNA—miRNA以及miR... 阅 读 全 部 >

2023
04-15

华中农大构建首个多物种中特异性蛋白介导的染色质环综合数据库ChromLoops

染色质环（或染色质相互作用）是染色质结构的重要组成元素（图1）。染色质环的破坏与癌症、多指畸形等多种疾病有关。目前，ChIA-PET、HiChIP和PLAC-Seq等技术可用于检测特异性蛋白质介导的高分辨率染色质环。近年随着3D基因组研究的快速进展，ChIA-PET、HiChIP和PLAC-Seq的数据集不断积累，亟需对这些数据集进行有效的收集和处理。图1. 染色质环（Chromatin loop... 阅 读 全 部 >

2023
03-28

如何分析TCGA数据之cBioportal网站

今天，小编将为大家介绍一个无需代码，并且免费使用的TCGA子数据库——cBioportal网站。毋庸置疑，这是一个科研汪们集万千宠爱的网站。首先，我们进入网站了解一下。官网网址为http://www.cbioportal.org/。进入官网后，主页分为以下三个区域，左侧的为选择研究的区域(按器官对各肿瘤分类)，中间是下载研究数据的区域，右侧区域是对各研究数据的一个总结及该癌种的临床信息。...阅读... 阅 读 全 部 >