Seurat对象剖析以及Seurat Command List前景回顾首次揭秘！不做实验也能发10+SCI，CNS级别空间转录组套路全解析（附超详细代码！）过关神助！99%审稿人必问，多数据集联合分析，你注意到这点了吗？太猛了！万字长文单细胞分析全流程讲解，看完就能发文章！建议收藏！（附代码）秀儿！10+生信分析最大的难点在这里！30多种方法怎么选？今天帮你解决！ ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
#单细胞测序的优势#近年来，快速发展的高通量测序，已经广泛应用于生命科学的各个领域。传统的混合细胞测序（bulk cells sequencing）检测的是数以万计的细胞群体平均后的表达水平，无法反应每个细胞的真实情况，这使得局部/微小组织的功能研究有了极高的门槛。同时，细胞异质性也成了研究组织中特殊种类的细胞功能作用时无法跨越的鸿沟。单细胞测序技术通过对单个细胞的RNA进行测序，精准得到单个细胞... 阅 读 全 部 >
据降维是数据分析中最常用到的一种技术了，这篇小文将试图用大白话讲一讲数据降维到底是什么，有什么用，常用的方法分别是什么？希望写的让小学生也能听懂，下面先为各位奉上这篇小文的思维导图。这篇文章贯穿始终的一个故事场景是如何在一个小镇上将横纵的街道编号，例如科技三路和凤城五路的接口这样一个用俩个数字标注的位置信息，转化更一个只用一个数字标识的位置描述。在上述的例子中，原来的位置信息有俩个维度，...阅读... 阅 读 全 部 >
国际顶级期刊经过四个多月的评选，《Cell》“Best of 2017”特刊中刊登其评选结果，包括“2017年度十大最佳论文”以及“2017年度四大最佳综述”。不出意料的是这些文章涵盖癌症、免疫学、干细胞、神经科学等热门研究领域，以及很火的AI技术在生物医学领域的研究进展。但是有一篇综述的入选确实有点出乎意外，就是这篇题为“Putting p53 in Context”的文章。为什么仅...阅读全... 阅 读 全 部 >
数据科学家通过许多工具软件利用庞大或者混杂数据去解决回答许多复杂的难题。数据科学问题种类包括：描述性分析（deive analyses）探索性分析（exploratory analyses）推断分析（inferential analyses）预测分析（predictive analyses）因果分析（casual analyses）...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
老规矩我们先上个链接https://genome.ucsc.edu/UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz于2000年7月创立的旨在通过它迅速而且可靠地浏览任何一部分基因组，并同时获得与该部分相关的基因注释信息，包含但不限于已知基因,预测基因，表达序列标签，信使RNA，CpG岛，小鼠同源性等等此类基因组学...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
RNA 代表核糖核酸和 siRNA——小干扰 RNA（也称为沉默 RNA）。siRNA 是分子中的一种短 (21-23 bp) 双链 RNA 核苷酸，在细胞中发挥各种生物系统的功能。siRNA转染是“转移”，将siRNA细胞内转移到细胞中，这是一个涉及基因沉默的过程。为了成功优化 siRNA 转染，需要合适的转染试剂和转染方法来进行体外和体内RNAi 实验。这些过程因细胞类型...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
Pfam: the protein families database11.501Nucleic Acids Res . 2014 Jan;42(Database issue):D222-30. doi: 10.1093/nar/gkt1223. Epub 2013 Nov 27.Abstract Pfam, available via servers in the UK (http:/... 阅... 阅 读 全 部 >
《R包学习》专栏·第3篇 文| R学习者2352字 | 6分钟阅读这是dplyr包系列第三篇文章。前两篇文章如下：前两篇文章是从 数据列的角度做选择和变换处理。这篇文章是从 数据行的角度，描写行选择的一系列操作与方法。数据的行，可以看作为 观察、样例、对象等。 数据的行选择，主要包括如下内容：1 基于比较运算的行选择2 基于字符匹配的行选择3 基于正则模式的行选择4 基于多条件的行选择5 跨越多列... 阅 读 全 部 >
现在搞科研，动不动就要接触高通量测序，想要来篇高分文章，没有高通量感觉都不太好意思，所以如果你还不知道什么是FASTQ和FASTA，那就太OUT了，其实他们在我们用的最多的PUBmed里随处可见：FASTQ是基于文本的，保存生物序列（通常是核酸序列）和其测序质量信息的标准格式。其序列以及质量信息都是使用一个ASCII字符标示。FASTQ格式中，每个序列通常有四行：第一行，序列标识以及相关的描述信息... 阅 读 全 部 >