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2020
01-24

高通量测序中的接头（adapter）到底是什么

首先放一张测序示意图，在DNA片段两端所加的序列即接头序列，也就是我们今天要讲述的主角。测序示意图1 基本概念1.1 adapter接头，为一段已知的短核苷酸序列，用于链接未知的目标测序片段1.2 index或barcode几个碱基组成的寡核苷酸链，用于在混合测序时，区分不同样本1.3 insert待测序的目标序...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2020
01-24

二代测序中barcodes index的介绍

刚接触高通量测序的同学，可能会接触到barcode index等名词。为什么要有barcodes ？原因很简单，一个lane有效数据30来G我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量，尤其是RNA-seq，哈哈，所以在建库的时候，对每一个样品接头上加上不同的标签序列，然后用于测序，在测序结果中，依据之前标签与样品的对应关系，就可以获得对应样品的数据，从而...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2020
01-24

李笑来：韭菜的快速成长之路

《韭菜的自我修养》一书并不厚，几个小时就能读完，读过的人，相信已经对其中的内容有了了解，也有自己的观察和思考。虽然李笑来老师强调的“只字不差”地阅读，但对于大部分人来说，即便“只字不差”地阅读，可能并不足以“只字不差”地理解。所以，这门课《韭菜的快速成长之路》会从视角、经历、从业观察来解读这本书，识别并理解“韭菜”这种生物，帮助你在货币交易的世界里避过一些坑，同时更加明白一个交易者在交易...阅读... 阅 读 全 部 >
2020
01-05

生信分析必须了解的4种文件格式

在做生物信息的过程中，经常需要进行各种文件格式。每一种生物软件都有固定的文件格式要求。因此，需要非常每一种数据的文件格式，从某种意义上来说，生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。例如当前很多分析都可以概括为从fastq到bam，从bam到vcf的过程。fasta文件格式FASTA文件主要用于存储生物的序列文件，例如基因组，基因的核酸序列以及氨基酸等，是最常见的生物序列格...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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