ROSE 软件挖掘「超级增强子」实战与代码分享
学术分享 | 审稿人谈审稿与投稿：从2篇拒稿说起
当审稿人看到你的论文想拒稿时，他到底看到了什么？
长读长测序（ LRS）技术被《Nature Methods》评为“2022年度方法”，被广泛用于许多代表性物种的基因组测序中。该技术在科学研究中具有巨大作用和潜力，2021年LRS的市场价值为13.5亿美元，预计到2031年将达到44亿美元，从2022年到2031年的年均复合增长率达到14.4%。 在本文中，作者讨论了LRS技术的应用现状和优势、LRS的成功案例和新发现、LRS在植物基因...阅读... 阅 读 全 部 >
淹水胁迫对植物的生长发育有负面影响，研究耐涝机制对分子育种的研究具有重要意义。中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料，结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析，揭示了猕猴桃的耐涝机制，并在《International Journal of Molecular Sciences》（IF=6.208/化学2区）期刊上发表了题为“Full-Length ...阅读... 阅 读 全 部 >
导读三代测序和de novo组装技术发展得如火如荼，是如今高通量测序最热门的技术。今天为大家分享一篇三代测序和de novo组装在植物方面应用的综述文章，希望帮助更多的科研小伙伴们了解这项技术，并应用到自己的科研工作中。发表期刊：Current Opinion in Plant Biology发表时间：2020.01.22影响因子：7.508...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
近两三年中，测序平台又有了突破式的革新。虽然Illumina的二代测序平台仍是市场主流，但随着Pacific Biosciences公司商业化的三代测序仪平台成功推出，三代测序已正式应用于各项研究中。与之前的平台相比，三代测序技术无需PCR扩增就可实现对每一条DNA分子的单独测序。由于三代测序读长长、无扩增及GC偏好性，目前广泛应用于动植物de novo测序辅助组装及全长转录组测序。那么三代测序在... 阅 读 全 部 >
上次小编给大家介绍了，大家看过之后是不是也有一种想发高分文章的冲动？古语云“九层之台，起于累土”，今天小编就给大家重点介绍一下好文章背后的故事------PacBio三代测序的文库制备。首先，我们来认识一下三代测序的文库结构，与二代测序线状的文库结构不同，三代测序的文库是“哑铃型”的环状结构，中间是插入片段，两端分别是茎环结构的接头（图1）。这种“哑铃型”文库是三代文库设计的最大亮点，环状的文..... 阅 读 全 部 >
中文名: PacBio 单分子长读长测序揭示了木荷树苗中锰胁迫耐受机制的关键基因英文名: PacBio Single-Molecule Long-Read Sequencing Reveals Genes Tolerating Manganese Stress in Schima superba Saplings杂志：Frontiers in Genetics影响因子：4.599研究背...阅读全... 阅 读 全 部 >
作者：Lily导读：可访问的染色质区域（the accessible chromatin regions）在人类基因组调控元件（regulatory elements）中富集。通过对可访问的染色质区域的研究，科学家们已鉴定出许多与人类疾病相关的遗传变异。目前，对单个细胞内开放染色质区域进行检测的一种成熟方法是：通过下一代测序（NGS）平台，使用测序技术对转座酶可及性染色质（tra...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
在人类探索生命奥秘的旅程中，基因图谱就像一张神奇的地图，指引我们穿越生命的复杂迷宫。这张“地图”不仅揭示了物种如何传递遗传信息，还为医学、农业、生态保护等领域带来了革命性的改变。科学家正不断探索这张“地图”上的未知大陆，解锁生命发展的更多秘密，揭示隐藏在基因背后的无限可能性。文/倪江飞 何卫华 王国强倪江飞，中国科协创新战略研究院助理研究员。何卫华，中国科协创新战略研究院博士后。王国强，中国科协创... 阅 读 全 部 >
转眼间，十月已经到来，十月是一个充满希望的时节，是一个硕果累累的季节。在这么美好的时节里小锐有很多新技术、好消息与大家分享，接下来先向大家隆重介绍三代+二代宏基因组测序分析产品。随着测序技术的不断更新，三代测序技术也越来越成熟，Nanopore测序读长更长，错误率更低，对生物信息相关领域的研究具有重大意义。近年来Nanopore测序的宏基因组高分文章已发表多篇，且已成功应用于微生物宏基因组研究领域... 阅 读 全 部 >
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