对高通量测序数据进行比对，就是将测序得到的reads定位到基因组序列上，对illumina或454得到的short reads比对的软件主要有Bowtie BWA HISAT Tophat。SAM格式，是序列比对文件的格式。分为头部区和主体区，都以tab分列。@HD VN:1.0 SO:unsorted头部区第一行，VN是格式版本，SO是比对的类型，有unknown,unsorted,q...阅读... 阅 读 全 部 >
如果你对生物信息不那么了解，或许会搞混FASTQ和FASTA，它们都是序列保存的一种格式，是用于NGS分析的基础数据。其实二者很好区分，并且可以通过一定的处理进行格式转换。FASTQFASTQ：是基于文本的，保存生物序列（通常是核酸序列）和其测序质量信息的标准格式。你拿到的测序数据均是fastq格式的。其序列以及质量信息都是使用一个ASCII字符标示，最初是由Sanger开发，目的是将F...阅读... 阅 读 全 部 >
生信分析过程中，会与很多不同格式的文件打交道，除了原始测序数据 fastq 之外，还需要准备基因组文件 fasta 格式和基因注释文件 gtf 格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如 bed 、 bed12 、 sam 、 bam 、 wig 、 bigwig 、 bedgraph 等，生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义，以此来决定需要提取哪些有用信息列来进行下...阅读全文... 阅 读 全 部 >
生信分析过程中，会与很多不同格式的文件打交道，除了原始测序数据 fastq 之外，还需要准备基因组文件 fasta 格式和基因注释文件 gtf 格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如 bed 、 bed12 、 sam 、 bam 、 wig 、 bigwig 、 bedgraph 等，生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义，以此来决定需要提取哪些有用信息列来进行下...阅读全文... 阅 读 全 部 >
一、前言 之前有说过，Zotero一大好处就是开源，免费。而软件开源的好处是，会有很多技术大拿一起再GitHub上面给软件写各种各样强大的插件。Zotero就是如此，借助于插件， Zotero战斗能力倍增，可以让大家更为轻松自如地学习与管理文献。今天，小编就为大家带来Zotfile这个插件，感受下开源软件的人性化设计。 二、Zotfile 插件的使用 2.1 安装 直接进入Zotfile... 阅 读 全 部 >
1.安装ZotFile插件*** 以后补充 ***2.配置ZotFile 配置 3.整理操作（1）将文件拖进Zotero软件相应的目录（自己创建） （2）查看文件位置 （未整理之前） （3）整理 （实质是拷贝了一个新文件，按照命名规则对文件进行了重命名，并存储到了自定义的目录下如：本配置中的 “E:\workspace\Zotero\Paper... 阅读... 阅 读 全 部 >
快捷、方便、直观的实现文件批量改名。 支持所有文件格式；支持自动排列序号；支持改变扩展名（后缀名）；支持修改文件属性（只读、隐藏文件）；支持文件名部分替换；支持在原文件名前插入字符；支持在原文件名后插入字符；支持改名后另存到指定文件夹，保留原文件；支持预览； 文件批量改名v3....阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
这两天“圈内”都流传着QQ群文件破群规无限制上传的漏洞。可以实现无限制的在任何群内上传任何文件，包括设置了禁止普通群成员上传文件的QQ群。且可以实现上传文件后“隐身”，不被群主或管理员发现。标题或许有些夸张，但博主觉得还比较实用，故分享给大家，希望对大家有所帮助。具体操作步骤如下：1、找到可以上传文件的QQ群，上传需要上传的文件。2、在已上传QQ群点击“转发”，转发可以同时转发...阅读全文>... 阅 读 全 部 >