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2022
05-03

两个在线网站搞定KEGG通路富集分析!

在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天就来介绍一下如何使用在线分析工具DAVID与KOBAS的进行KEGG通路富集分析

操作步骤

进入DAVIDhttps://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp上传基因列表

选择物种

开始分析

择转换 选择格式,按照ENTREZ_GENE_ID 转换好了,下载结果 用excel打开 进入KOBAS http://kobas.cbi.pku.edu.cn/index.php http://kobas.cbi.pku.edu.cn/

选择类型,选择物种,输入ID号 选择KEGG分析 选择校正方法 开始跑

结果出来了,下载 用excel打开,可以看到富集的通路,基因,以及校正值,还有网页链接 打开链接可以看到具体的通路 好了,以上就是使用DAVID和KOBAS进行KEGG通路富集分析的操作, 希望对你有所帮助。如果对操作 有什么问题欢迎评论区留言讨论。

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作者:萌小白
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