分类目录归档：

2022
07-10

ceRNA常用鉴定和预测工具介绍

已经陆续为大家介绍了ceRNA研究的建库方法（文章：），还有ceRNA之间的调控关系（文章：），这篇就来总结一下miRNA、 lncRNA、circRNA鉴定及靶向关系预测常用的分析工具。 miRNA鉴定去除低质量的数据，得到clean data后，还需要和Genebank、Rfam等数据库比对去除rRNA，scRNA，snoRNA，snRNA，tRNA等其它小RNA的tags，最后再进行mi..... 阅 读 全 部 >
2022
07-01

ceRNA介绍及分析研究策略

前言现在生物学研究中对RNA的研究与日俱增，siRNA，piRNA，miRNA, LncRNA一个个明星分子层出不穷。更有一些新的名词不断产生，如ceRNA。其实ceRNA的提出也有一段时间了，而且它并不是一种新的RNA分子，而是一种调控机制。在最近的研究中表明基因在转录调控中存在多种模式作用，microRNA作为其中一种重要的调控因子，是长短约22nt的短链RNA，能够通过抑制目...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2021
07-12

ncRNA分类及文章发表统计

基于生物研究的中心法则而言，一般来说一个基因是从DNA- RNA-蛋白的过程。但是在研究过程当中，总有一些基因是不会最后翻译成蛋白的。所以我们就把这种不翻译成蛋白的RNA叫做非编码RNA(non coding RNA, ncRNA)。这里我们就简单的总结一下ncRNA的分类。对于ncRNA的研究，随着研究的深入肯定会发现更多类型的ncRNA。这里我们是基于19年发表的一篇综述当中的分类来进...阅... 阅 读 全 部 >
2021
07-06

ncRNA系列专题（一）丨非编码RNA介绍---lncRNA与circRNA

蛋白质是生命体的构成者，生命活动的主要承担者。人们曾经一度认为只有编码蛋白的基因才具有重要功能。随着研究的深入，越来越多的证据表明DNA转录的非编码RNA并不是毫无作用的“垃圾”，其中的lncRNA，miRNA，circRNA可参与多种生物学进程，发挥重要的调控功能。今天我们先为大家简要介绍非编码RNA中其中的两个重量级成员——lncRNA和circRNA。后续我们会分期从研究策略和应用案例进行详... 阅 读 全 部 >
2021
07-01

非编码RNA类型及功能汇总

导语非编码RNA种类繁多，家族庞大，没一定的方法根本就记不住都有谁。麦子有一套记忆心得来帮助大家记住这些非编码RNA的种类和功能，免得老板问起来什么都不知道。非编码RNA由于功能强大，站上舞台摇曳生姿已久，前几日老谈问我：“非编码RNA除了热门的miRNA，lncRNA还有啥啊？”我本想不屑一顾，结果：“多呢，还有tRNA，rRNA, 什么什么RNA来着，反正那几个嘛！呀，我好忙呢！”额，只能一溜... 阅 读 全 部 >