对于可视化呈现来说，一个图表呈现的数据信息是有限的，更多时候，我们需要呈现的是多角度多维度的数据信息。这时候，就需要用在同一个版面上容纳多副相关的图表形成一个版面的可视化报告，今天是网易数独的一个数据报告，使用ggplot还原了（其中用到的国旗出现了点儿小bug，至今没有解决，有知情的的大神还望赐教！）library("tidyverse")library("scales")library...阅... 阅 读 全 部 >
暑假到了，在这个火热的夏日，还有比一张美丽的文章主图更能让我们充满激情和力量吗？在这组学撑起生物信息学半边天的时代，火山图，在转录组、蛋白组、代谢组等多种组学数据中，都占有举足轻重的地位。那么，什么是火山图（Volcano Plot）。正如名称所描述，火山图的图形非常像火山喷发的形状。火山图通常用来展示差异表达的基因，常常出现在芯片、转录组、蛋白组、代谢组等组学检测技术的结果中，并且通常...阅读... 阅 读 全 部 >
如果一篇科研论文没有 bar图，那它可能就不是一篇合格的科研论文。很多同学也许会问，bar图有什么难的，我科研论文做第一张图就是bar图，so~so~easy。其实bar图也有很多种的，最大的差别，就是我们家的 bar图和别人家的bar图。为什么别人家的 bar图可以上CNS，我们家的bar图match却只能在一两分的角落里画圈圈呢。当然实验设计和内容绝对占99...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
误差线通常用于统计或科学数据中，显示潜在的误差或相对于系列中每个数据标志的不确定程度。一般通用的误差线为标准差（平均偏差）或标准误差。今天介绍两种使用R语言添加误差线的方法，分别是大家常用的ggplot2和基于它的ggpubr。方法A首先介绍大家比较熟悉的ggplot2包第一步：包的安装和数据准备这里使用R中的范例数据集：ToothGrowth。它描述了维他命C...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
本文首发于微信公众号 *“ 生信补给站 ” ，期待您的关注！！！*"一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attributes, 缩写为aes, 包括颜色、形状、大小等)的一个映射。此外, 图形中还可能包含数据的统计变换(statistical transformatio...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
一般来说，数据分析分为统计检验和可视化两个部分。今天给大家分享一个R包，可将这两个部分合二为一，不仅能够画出美观精致的图表，还能够同时展现统计分析的详细结果，简直“一石二鸟”、“一举两得”！这个包为ggstatsplot，非常适合做统计分析的科研工作者们，赶紧用起来！#所需R包的安装和载入remotes::install_github( "IndrajeetPatil/ggstatsplot"..... 阅 读 全 部 >
背景介绍写论文画图的时候小提琴图，热图，箱线图，画来画去都长得差不多，是不是觉得很烦恼？今天小编为大家介绍一个可以让科研论文统计绘图颜值提升好几个level的R包：ggstatsplot。ggstatsplot是ggplot2的扩展，用于绘制带有统计检验信息的图形。ggstatsplot采用典型的探索性数据分析工作流，将数据可视化和统计建模作为两个不同的阶段；可视化为建模提供依据...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
作者简介Introductiontaoyan：伪码农，R语言爱好者，爱开源。个人博客: https://ytlogos.github.io/公众号：生信大讲堂上次提了下theme(),本文将专门讲解一下。凡是与数据无关的图形设置可以归为主题类，ggplot2中主题设置十分多，根本不可能讲解完，只能稍微讲点皮毛，灵活运用才是关键，本文只是总体上略作介绍。正如R语言大神Hadley Wickham..... 阅 读 全 部 >
ggThemeAssist：鼠标调整主题，并返回代码R语言中的ggplot2是最美的绘图包之一。但调整主题的细节，需要写大量代码，而且反复修改、预览，费时费力。当然你可以用Adobe Illustrator等工具进行后期编辑，但要是图重画，所有后期编辑的工作又要重来，无法实现可重复分析，每个修改都很崩溃。有没有更方便的方式调整主题细节呢？ggTheme...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
真不想要ggplot2的默认配色，毫无美感呐~可以自己设置的呀！详细教程奉上，拿走不谢哟~ggplot2是R语言中常用的包，它具有强大的绘图功能，在生物学数据可视化过程中，有很多图都是用ggplot2画出来的。但是有时候我们并不想要ggplot2的默认配色，如何修改呢？下面我们来告诉大家，如何在ggplot2中设置自己想要的颜色！一步一步往下看好看就右下边给我一朵小花花示例数据：...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >