DNA样品质控尽管最佳的裂解和孵育条件可从FFPE样品中释放DNA，部分逆转甲醛修饰，但对于纯化后DNA的下游分析，仍有一些限制。首先，固定过程中的化学修饰可能引入不想要的序列变化，降低DNA稳定性和酶学分析的效率，让A260/A280的纯度分析变得困难。其次，由于FFPE样品中的DNA随时间而逐渐片段化，故只能分析短序列（例如在PCR应用中，应当设计产生短扩增子的引物）。此外，较短的D...阅读... 阅 读 全 部 >
FFPE样本是医学领域常见的生物材料。此类样本已经被广泛应用于高通量测序、原位杂交、免疫组织化学等研究领域。目前，全球约有数亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究的最为宝贵的生物学资源之一。从FFPE中获得高质量核酸，是顺利推进下游实验的第一步。那么，如何从FFPE样本中获得高品质的核酸来进行下游实验呢？今天小编就来为您支招儿！01什么是FFPE样本？FFPE（For...阅读全... 阅 读 全 部 >
上期回顾：FFPE样本制备及分析（上篇）| 实验技术专题0 1样本切片石蜡样本在提取前需要进行切片处理，一般需要5-6个切片，一片镜检确定肿瘤细胞含量，其他进行后续提取处理。切片的薄厚程度对后续观察和提取会有一定影响。切片过厚不利于后续染色和组织学观察，而且组织脱蜡和蛋白酶消化困难增加；切片过薄易造成DNA的机械损伤，同时切片总面积的增加，其表面黏附的PCR抑制因子将可能...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
肿瘤组织是几乎唯一一种病人愿意让医生切下来的组织，医生对这些组织进行回顾性研究，有助于阐明疾病机制，发现治疗靶标和指示预后恢复。但离体的组织容易丧失原有正常的结构和功能，一般医院没有太好的超低温冷藏条件，而使用福尔马林固定石蜡包埋处理的样本（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE）可以在常温保留很久，所以对肿瘤组织进行石蜡包埋保存就成了医院里最常用的..... 阅 读 全 部 >
想验证miRNA和靶基因的靶向互作？想知道转录因子与启动子的调控机制？想研究启动子的结构？想分析转录因子的转录激活……这些统统可以用双荧光素酶报告基因检测实验来实现，是不是很强大！那么如此强大的实验你了解多少呢？这么多的应用你会不会一脸懵呢？双荧光素酶报告基因到底是个啥“玩意儿”可以进行做这么多的实验？这些问题想要找到答案就跟着小远的文章往下看吧！原理简介荧光素酶（Luc...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
荧光素酶因为具有灵敏度高、检测快速、方便等特点而被广泛开发应用。萤光素酶是理想的报告基因，哺乳动物细胞中不含内源性萤光素酶，且其一转录完成立刻就生成功能性的萤光素酶。荧光素酶(Luciferase)报告系统是指以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶活性的一种报告系统。荧光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin，在luciferin氧化的过程中...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
国家自然科学基金可以帮助研究型临床医生和科学家成长，在成长过程中国自然标书的申请，以及成果的转化，是一个永恒的话题。我们知道，国自然的转化成果类型包括：期刊论文、专利、会议论文、奖励、专著。那么工具病毒是如何助力老师们的国自然成果转化呢？为了便于老师们理解工具病毒的功能与应用场景，我从国自然官网上检索出了腺相关病毒[1]、慢病毒[2]、腺病毒[3]助力，国自然成果转化的期刊论文，进行简要解读...... 阅 读 全 部 >
今天就跟大家分享一篇 巨简单的生信分析 + 巨简单的实验发 7+ 的非肿瘤研究生信文章，看完直呼：我也行！ 文章题目：Identification and Clinical Validation of Key Extracellular Proteins as the Potential Biomarkers in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosi...阅... 阅 读 全 部 >
大家好，我是蟀小伙儿，单基因文章想必大家都不陌生，近年来，单基因的文章层出不穷，内容也是五花八门，今天蟀小伙儿就和大家一起研究一篇发表在Oncoimmunology上的经典单基因文献，这篇文章内容非常丰富，但整体难度不是很大，希望能给想做单基因项目的小伙伴提供一些灵感～ 一、背景①口腔鳞状细胞癌（OSCC）是头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）最常见的亚型，其转移和复发率高，且对传统化疗耐药。 ②CD8... 阅 读 全 部 >
编者按：代谢组学数据下机啦~如何进行数据筛选？如何进行数据标准化处理？本篇小鹿“安利“一款实用软件：无需复杂的EXCEL操作；无需自己写代码；也无需自己写脚本；可解决代谢组学下机数据地复杂分析？不相信请各位“看官”继续往下看...MetaboAnalyst工具软件MetaboAnalyst是一个基于网络的综合性工具套件，旨在帮助用户...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >