高通量序列比对文件一般可以使用服务器查看，但是如果没有服务器，我们该如何查看呢？这时，就该Tablet软件出场了！
操作步骤
我们首先下载安装好Tablet软件
首先，我们准备好高通量序列比对的结果文件，可以是以下格式。BAMSAMACEAFGMAQSOAPAligner
这里，我们以BAM文件为例，首先，点击open
这里，我们准备好BAM文件和基因组注释GTF文件 
打开后，可以看到CONTIG界面，我们可以选择需要的CONTIG或染色体进行查看 
点击以后，出现序列比对的缩略图，我们可以直接选择区域进行查看 
点击之后，出现具体的序列比对情况，我们可以查看reads比对到基因组相应位置上的具体情况 
我们可以选择导入更多的基因组特征或者酶切位点进行查看
另外，我们可以选择是否用pair end的形式查看 
也可以点击tag variants，对变异区域进行上色，方便选择高变区域进行查看 
可以选择上色方式，如对序列方向，编译位点进行上色 
也可以自定义规则进行上色
在上方窗口可以选择指定位置及特征进行查看
可以设定滑动窗口大小 
查看测序覆盖度 
此外，可以导出高清的图像以及测序覆盖度的总结 
好了，以上就是使用Tablet快速查看高通量比对数据的操作，希望对你有所帮助。- 本文固定链接: https://www.maimengkong.com/moreshare/905.html
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