对于本来就没有多少时间做科研的医学生来说，拿到导师布置的课题时总是如履薄冰，因为导师总是一字千金，就简简单单说一句你去研究什么什么蛋白的功能，而后所有的背景知识都需要自己去查，如何才能快速的掌握自己需要研究蛋白的全部知识呢？今天笔者拿出多年的珍藏，给大家分享一个超好用的数据库SMART。
进入SMART数据库，网址为http://smart.embl-heidelberg.de/.进入网站首页，可以看到该网站也是相当简洁，最近两次更新的文章都发表在Nucleic Acids Res杂志上，影响因子为11.561。
在网页的上方，可以看到SMART有两种模式，分别为NORMAL何GENOMIC，点击SMART MODE可以看到对着两种模式的解释。这两种模式的主要区别是使用的数据库不同，NORMAL模式包含Swiss-Prot, SP-TrEMBL 和 Ensembl三个数据库；而GENOMIC模式是使用已经完成测序的蛋白质组数据。此外，两种模式的界面颜色也不相同，这样便于区别自己目前所用的模式，但是两种模式的搜索界面内容是相同的。
这里我们选择NORMAL模式，进入搜索界面，可以看到能够根据不同的方式查询目的蛋白，可以是序列ID号或者ACC号，也可以根据蛋白的序列，这里我们选择第一个范例——人源TEC蛋白，点击“#1”。
随后选择Sequence AMART进行分析，可以看到在图中会显示TEC蛋白的各个结构域的名称，将鼠标放置结构域上，还能显示各个结构域的氨基酸范围和数目。在各个结构域中出现的竖线表示内含子，点击上方的Introns按钮，这些竖线将会消失。与此同时，上方还有“+”和“-”按钮，可以根据需要对结构域图片进行放大和缩小，点击后面的SAVE，还能直接将结构域图片进行下载，可以直接放在文章中额。
在网页的下方，可以看到该TEC蛋白各个结构域的信息和氨基酸起始位置，这为我们研究相互作用domain提供非常大的便利。
在中间部分还可以看到该蛋白的一些信息，下面一一为大家讲解。
1. Information：该栏中显示了蛋白的基本信息，包括其氨基酸数目，不同数据库中的序列号以及不同的剪接体。
2. Architecture：进入该选项后，可以看到有两种选择，分别为Domain organization和Domain composition，通过不同的方式搜索和TEC类似的蛋白。
Domain organization是指包含TEC蛋白的所有结构域的蛋白质，点击后可以看到需要选择物种，这里我们选择所有的真核生物。
点击上方的Display proteins，可以看到会出现有很多包含TEC全部结构域的蛋白质。
Domain composition是指和TEC含有相同结构域的蛋白质，进入该选项，选择真核生物后同样可以获得与TEC类似的蛋白质。
3. Interactions：该栏中显示了TEC蛋白互作图，可以清楚的看到TEC和其他蛋白的相互作用情况，并且这个数据是直接链接到string数据库的，点击任何一个蛋白，就可以直接进入sting网站，非常方便。
4. Pathways：该栏目显示TEC涉及的信号通路，其中有两个选择，分别为map04660和K07364。
map04660是该蛋白涉及的T细胞受体信号通路，进入该选项后，可以看到信号通路图，这个图也是可以放大后直接下载使用的。
K07364选项是基于相似的KEGG同源组，目前涉及该蛋白的KEGG图还没有更新到，因此暂时搜索不到。
5. PTMs：该栏目显示的是TEC蛋白翻译后修饰情况，可以看到，该蛋白上总共含有44个修饰，包括35个磷酸化修饰，6个泛素化修饰和3个乙酰化修饰。
6. Orthology：该栏中可以查询到TEC在各个种属中的同源物。
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