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2023
10-07

GENEPOP:一个非常实用的群体遗传学分析软件

GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析下面我们就来介绍一下它的使用方法。

操作步骤

先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下,删除其他之前运行剩下的结果文件,仅保留三个文件

运行软件,输入输入文件的名称 确认信息,回车 可以进行很多项分析 一共有8个选项: 1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种群整体平衡状态的检验,选1回车开始Hardy-Weinberg test, 选择1,回车 然后连续三个回车,按默认参数进行,得到结果。 2.genotypic disequilibrium:进行连锁不平衡的分析,选2进入,选1进行分析 3.population differentiation:进行遗传分化的检验 4.Nm estimate:对基因流进行估计 5.Allele frequencies,various Fis,gene diversities:估计等位基因频率 6.Fst:估计群体间联系 7.file conversion:进行格式转换,可以转换为FSTAT格式的 8.Null alleles:计算无效等位基因

好了,以上就是Genepop教程希望对你有所帮助。如果对Genepop的使用有什么问题欢迎评论区留言讨论。



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作者:萌小白
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