2020 01-29 扩增子图表解读2散点图:组间整体差异分析(Beta多样性) 背景介绍(Introduction)宏基因组学宏基因组学目前的主要研究方法包括:16S/ITS/18S扩增子、宏基因组、宏转录组和代谢组,其中以扩增子研究最为广泛。目的意义本系列文章将带领大家结合较新的16S扩增子相关文献,来理解宏基因组16S扩增子文章中常用图表种类、图中包括的基本信息,以及作者想表达的结果。主要内容本系列文章内容包括:箱线图、散点图、热图、曼哈顿图、维恩图、三元图和...阅读全... 阅 读 全 部 >
2019 06-28 DNA提取过程中各种试剂的作用 EDTA螯合Mg2+、Ca2+等金属离子;抑制脱氧核糖核酸酶(DNase)对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。SDSSDS是离子型表面活性剂;溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白,从而破坏细胞膜;解聚细胞中的核蛋白;SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2019 01-20 16S 基础知识、分析工具和分析流程详解 16S概念什么是16S?S是什么意思?16S分析是用来干嘛的?能分析什么?16S大致的分析原理是什么?有点生物学基础的会知道16S和核糖体有关,但大多数还是搞不清楚它们之间的关系。先明确一些概念:核糖体:Ribosome,由 RNA(rRNA)和蛋白质 组成,配合 tRNA 来翻译 mRNA。核糖体按沉降系数来分类,S就是沉降...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >